המכון הציע בשנותיו הראשונות התמחות צנועה בלימודים עירוניים ואזוריים, כאשר כל מחזור כלל מספר מצומצם של תלמידים, אך בשנות השמונים והתשעים של המאה העשרים התפתח המכון לאחת משתי התוכניות המובילות בישראל בלימודים עירוניים ובתכנון עירוני. תכנית הלימודים הורחבה והועמקה ומספר התלמידים במכון גדל פי ארבעה בתחילת שנות התשעים. גידול זה הושפע מההתפתחות הרבה של מקצוע תכנון הערים בישראל ובעולם, שהפך יותר ויותר לאינטרדיסציפלינרי ובעל אוריינטציה למדעי החברה, ומהביקוש הרב למתכננים, כתוצאה מגל העלייה מארצות חבר העמים ומתנופת הבנייה בשנים ההן. לצד פרופ' אריה שחר, ניהלו את המכון בשנים אלו פרופ' שלמה חסון, פרופ' דניאל פלזנשטיין ופרופ' ערן רזין.
בעשור השני של שנות האלפיים עלה המכון ללימודים עירוניים ואזוריים מדרגה נוספת, התכנית שודרגה, מספר התלמידים גדל עוד יותר, ומשנת 2016/17 מוצע תואר בגאוגרפיה ותכנון עירוני ואזורי, לצד ההתמחויות בתכנון עירוני ואזורי ובלימודים עירוניים ואזוריים. ההתעניינות הגדלה בלימודים עירוניים ובמקצוע התכנון קשורים גם למשבר הדיור המתמשך ולמחאה החברתית, והרפורמות בחוק התכנון והבנייה תרמו ככל הנראה גם הם לעליית קרנו של מקצוע תכנון הערים בשנים האחרונות.